上海中医药大学创新中药研究院工会成立于2018年，目前共有现有会员58名，下设3个工会小组。
创新中药研究院工会在院党总支和学校工会领导下，在学院行政的大力支持下，积极做好各方面的工作。从组建至今，紧紧围绕学校的中心工作，为教职工服务，为学校的改革和发展服务。积极组织全院教工参加学校工会组织的各项文体活动，如朗诵比赛、舞蹈大赛、田径运动会、趣味运动会等，并取得优异成绩，丰富了教职工课余文化生活，加强了教职工之间的沟通和交流。积极开展评优树先活动，推动工会工作不断向前稳步发展。积极维护教职工权益，帮助困难职工，努力为教职工，排忧解难。
工会是学院与广大教职工的桥梁和纽带，将带领全院教职工为学院的建设、发展与稳定贡献力量，为建设双一流的上海中医药大学做出积极贡献。
工会委员会：
主席：冯陈国 副主席：吴飞
委员：王琼（宣传委员）郑幼镭（女工委员）
工会小组设置：
制剂工程中心工会小组 负责人：吴飞
安评中心工会小组负责人：王琼
手性药物研究中心工会小组 组长：杨笑迪，会员：赵群飞、李瑞翔
创新中药研究院第九届教代会我院代表名单：黄怡文、谷颖敏、王源、姚广涛、缪晓