本机构全称为“上海中医药大学药物安全评价研究中心”， 简称“上海中医大安评中心”；全称英译为“Center for Drug Safety Evaluation and Research, Shanghai University of Traditional Chinese Medicine”，简称为“CDSER, SHUTCM”。
本机构设主任1名、副主任兼QA主任1名，中心顾问1名，机构负责人及中心顾问由学校任命，质量保证部门负责人由机构负责人任命。本机构设质量保证室、综合办公室、档案管理室、供试样品室、设备管理室、动物管理室、临床检验室、毒理研究室、病理研究室、药代毒代室等科室，分别负责相关工作。